Publications HAL de Claire ,GUERRIER du labo/EPI Jean Alexandre Dieudonné

2024

Pré-publication, Document de travail

titre
Nonlinear coupling of the Poisson-Nernst Planck system of equations using the Discrete Duality Finite Volumes method, application to ionic and voltage dynamics in neuronal compartments
auteur
Claire Guerrier, Stella Krell, Paul Paragot
article
2024
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https://cnrs.hal.science/hal-04385924/file/Paper_PNP_Neuro.pdf BibTex

2023

Article dans une revue

titre
An Algorithm Based on a Cable-Nernst Planck Model Predicting Synaptic Activity throughout the Dendritic Arbor with Micron Specificity
auteur
Claire Guerrier, Tristan Dellazizzo Toth, Nicolas Galtier, Kurt Haas
article
Neuroinformatics, 2023, 21 (1), pp.207-220. ⟨10.1007/s12021-022-09609-z⟩
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https://hal.science/hal-04039624/file/Predicting_synaptic_activity_paper_HAL.pdf BibTex

2022

Article dans une revue

titre
Sinaps: A Python library to simulate voltage dynamics and ionic electrodiffusion in neurons
auteur
Nicolas Galtier, Claire Guerrier
article
Journal of Open Source Software, 2022, 7 (73), pp.4012. ⟨10.21105/joss.04012⟩
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2018

Article dans une revue

titre
The First 100 nm Inside the Pre-synaptic Terminal Where Calcium Diffusion Triggers Vesicular Release
auteur
Claire Guerrier, David Holcman
article
Frontiers in Synaptic Neuroscience, 2018, 10, pp.23. ⟨10.3389/fnsyn.2018.00023⟩
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https://hal.science/hal-03431628/file/fnsyn-10-00023.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Automating Event-detection of Brain Neuron Synaptic Activity and Action Potential Firing in vivo using a Random-access Multiphoton Laser Scanning Microscope for Real-time Analysis
auteur
Kelly Sakaki, Patrick Coleman, Tristan Dellazizzo Toth, Claire Guerrier, Kurt Haas
article
40th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society (EMBC), Jul 2018, Honolulu, France. pp.1-7, ⟨10.1109/EMBC.2018.8512983⟩
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2017

Article dans une revue

titre
Multiscale models and stochastic simulation methods for computing rare but key binding events in cell biology
auteur
Claire Guerrier, D. Holcman
article
Journal of Computational Physics, 2017, 340, pp.617-638. ⟨10.1016/j.jcp.2017.03.058⟩
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2016

Article dans une revue

titre
Hybrid Markov-mass action law model for cell activation by rare binding events: Application to calcium induced vesicular release at neuronal synapses
auteur
Claire Guerrier, David Holcman
article
Scientific Reports, 2016, 6 (1), ⟨10.1038/srep35506⟩
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https://hal.science/hal-03431644/file/srep35506.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
Robust network oscillations during mammalian respiratory rhythm generation driven by synaptic dynamics
auteur
Claire Guerrier, John Hayes, Gilles Fortin, David Holcman
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, 112 (31), pp.9728-9733. ⟨10.1073/pnas.1421997112⟩
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titre
Search Time for a Small Ribbon and Application to Vesicular Release at Neuronal Synapses
auteur
Claire Guerrier, D. Holcman
article
Multiscale Modeling and Simulation: A SIAM Interdisciplinary Journal, 2015, 13 (4), pp.1173-1193. ⟨10.1137/15M1009512⟩
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Thèse

titre
Multi-scale modeling and asymptotic analysis for neuronal synapses and networks
auteur
Claire Guerrier
article
Mathematics [math]. Université Paris 6 - Pierre et Marie Curie, 2015. English. ⟨NNT : ⟩
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https://hal.science/tel-04039715/file/These_1.pdf BibTex

2014

Article dans une revue

titre
Brownian search for targets hidden in cusp-like pockets: Progress and Applications
auteur
Claire Guerrier, D. Holcman
article
The European Physical Journal. Special Topics, 2014, 223 (14), pp.3273-3285. ⟨10.1140/epjst/e2014-02332-6⟩
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Chapitre d'ouvrage

titre
Calcium Dynamics in Neuronal Microdomains: Modeling, Stochastic Simulations, and Data Analysis
auteur
Claire Guerrier, E. Korkotian, D. Holcman
article
Encyclopedia of Computational Neuroscience, Springer New York, pp.1-37, 2014, ⟨10.1007/978-1-4614-7320-6_179-1⟩
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